לישראל וגואטמלה קשרים היסטורים וקרובים מאוד הכוללים שיתופי פעולה כלכלים ובתחום הסחר הביטחוני. גואטמלה הייתה בין תשעת המדינות שהתנגדו להצעת ההחלטה הדוחה את הכרזת נשיא ארה"ב דונלד טראמפ כי ארה"ב מכירה בעיר ירושלים בירת ישראל. בשנת 1980 לאחר שישראל חוקקה את חוק ירושלים, התקבלה החלטה באו"ם שהתנגדה לחוק ובעקבותיה 12 מדינות להן היו שגרירויות בירושלים, לרבות גואטמאלה, מדינות נוספות מאמריקה הלטינית והולנד, הוציאו את שגרירויותיהן אל מחוץ לעיר.