לאחר שמוחמד מורסי עלה לשלטון ביוני 2012, החריפה רדיפת הקופטים ברחבי מצריים. הרדיפה כללה הצתת כנסיות, מנזרים ומבני מגורים של אזרחים קופטים, רצח אזרחים ומקרים רבים של אלימות נגדם. לאחר כשנה, משתפס עבד אל-פתאח א-סיסי, את השלטון, הפגיעה בקופטים פחתה.