פרקליטות מחוז מרכז הגישה הבוקר (חמישי) לבית המשפט המחוזי כתב אישום נגד אסעד אל-ריפאעי וסובחי אבו שקיר, המחבלים שביצעו את הפיגוע באלעד. השניים נאשמים בשלושה מקרי רצח בנסיבות מחמירות של מעשה טרור, ועוד חמישה ניסיונות של רצח. בית המשפט האריך את מעצרם עד ה-4 ליולי. ראש העיר אלעד, ישראל פרוש, תקף את המחבלים בצעקות: "כלבים, סמרטוטים. מגיע לכם עונש מוות".
על פי כתב האישום, הנאשמים תכננו לבצע פיגוע רצחני בישראל ממניעים לאומניים ואידיאולוגיים, במטרה לגרום למותם של יהודים באשר הם. לצורך כך הצטיידו מבעוד מועד בסכינים וגרזנים, ונכנסו לישראל שלא כדין בתאריך 5 במאי.
בהגיעם לעיר אלעד, רצחו הנאשמים בדקירות סכין מרובות בפניו ובצווארו את הנהג אורן בן יפתח (35) שהסיע אותם אותם מהגדר מבלי שידע על כוונתם, ומיד לאחר מכן יצאו למסע הרג ברחובות העיר, כשהם חמושים בגרזנים.
במהלך מסע ההרג רצחו הנאשמים שני קורבנות נוספים, יונתן חבקוק (44) ובועז גול (49), וניסו לרצוח חמישה אזרחים נוספים. השניים נמלטו מהמקום והמשיכו במנוסתם במשך שלושה ימים, עד שנלכדו בשטח הפתוח שבין אלעד לקיבוץ נחשונים, כקילומטר וחצי מזירת הפיגוע.
השניים, שנתפסו על-ידי אנשי מילואים של יחידת מרעול ולוחמי יחידות מיוחדות, לא התנגדו למעצר ומיד נכנעו. מהחקירה עלה המחבלים לא משתייכים לארגון טרור, והחליטו יחד לבצע פיגוע בישראל. הם בחרו להגיע לאלעד, שבה עבדו ללא היתר ואותה הכירו היטב.