כוחות הביטחון נערכים החל מהבוקר (ראשון) בכוחות מתוגברים לקראת אירועי יום ירושלים שייערכו היום ברחבי העיר. שוטרים, לוחמי מג"ב ומתנדבים ייפרסו לשמירה על הסדר הציבורי והסדרת התנועה באירועים המרכזיים שיתקיימו בעיר לרגל 51 שנים למלחמת ששת הימים ואיחוד העיר.
מוקדם יותר היום פרצו עימותים בין יהודים לערבים בהר הבית. כוחות משטרה הפרידו בין שני הצדדים ופינו את היהודים מההר. ממשטרת ירושלים נמסר כי בעת סיור מבקרים יהודים בשטח הר הבית, כמה מהם הפרו את כללי הביקור ועוררו פרובוקציה, בעקבותיה הוצאו משטח ההר לצורך זיהויים ובירור הנסיבות. עם זאת, הביקורים בהר הבית נמשכים כסדרם. עוד נמסר מהמשטרה כי היא פועלת "במכלול של איזונים תוך שמירה על החוק וכללי המקום ולא תאפשר לאף גורם להפר את החוק בכל דרך".
אחד מהאירועים שייערכו היום הוא "ריקוד הדגלים" המסורתי בכותל, המשטרה קראה למשתתפים באירוע, בו נרשמים מדי שנה עימותים עם תושבי מזרח ירושלים, להישמע להוראות המארגנים, להימנע מכל גילוי של אלימות פיזית ומילולית ולאפשר לאירוע להתקיים כחוויה וחגיגה משמעותית תוך הקפדה על שמירת הסדר והחוק.
בין השעות 21:00-15:00, לרגל "ריקוד הדגלים", ייחסמו לתנועת כלי רכב הרחובות הבאים וכן הצירים המובילים אליהם: בן צבי, בצלאל, המלך ג'ורג', הלל, יפו, כיכר צה"ל, חיים בר לב, סולטאן סולימאן, דרך יריחו, כביש העופל. הרכבת הקלה תפעל בשני מסלולים מקוצרים מצפון בין פסגת זאב לשער שכם, ומדרום מהר הרצל לתחנה המרכזית. תחבורה ציבורית תתנהל בצירים חלופיים.
בערב, ייערך לקראת הטקס הממלכתי בגבעת התחמושת. עקב כך, מהשעה 18:00 ועד 23:00 ייחסם לתנועת כלי רכב רחוב שרגאי. השוטרים ייפרסו לשמירה על הסדר הציבורי, ביטחון הנפש והרכוש וקיומו התקין של האירוע לאורך הלילה.
לרגל הילולת שמואל הנביא תתמקד הערכות המשטרה בצירים המובילים למתחם קבר נבי סמואל ותתוגבר נוכחות ניידות לשמירה על ביטחונם של החוגגים,ל שמירת הסדר הציבורי ולהסדרת התנועה וזאת במטרה להקל על הציבור שמגיע להילולה ולמנוע עומסי תנועה בכניסה לאתר. לא תתאפשר הגעה לאתר או למקומות הסמוכים לו בכלי רכב פרטיים.
במהלך ימי ההילולה החל ממוצאי שבת ה-12 במאי, ועד ליום שני ה-14 במאי – יופעלו הסדרי התנועה הבאים: כביש 436 בין שכונת רמות לגבעת זאב ייחסם לתנועה לשני הכיוונים – הנסיעה בכביש תתאפשר רק לתחבורה ציבורית, רכבי הסעות ותושבי האזור בהצגת תעודה מזהה.