במקביל למשא ומתן האינטנסיבי בנושא הרפורמה בנמלים, צפויה הותמ"ל לאשר מחרתיים הקמת שכונה חדשה סמוך לנמל אשדוד, בניגוד לעמדת הנהלת הנמל וחברת נמלי ישראל. בהסתדרות חוששים כי הקמת השכונה החדשה עשויה לפגוע בפעילות הנמל ובכושרו התחרותי והכריזו על סכסוך עבודה.
"תוכנית זו הנה בעלת השלכות הרסניות על נתח משמעותי מפעילות הנמל השוטפת, ומכאן שהיא תביא לפגיעה בתנאי העבודה, בזכויות העובדים ובבטחונם התעסוקתי", נכתב בהכרזה על סכסוך העבודה. "החלטה זו תביא בין היתר גם לפגיעה בתחרותיות הנמל".
בדיווח לבית הדין הארצי לעבודה הבוקר, אמר יו"ר ההסתדרות אבי ניסנקורן כי החשש הוא כי השכונה צפויה להיות מוקמת בסמוך למתכני כיל בנמל, וכי החשש הוא כי תושביה יעתרו כנגד פריקת חומרים מסוכנים, עבודה רועשת או עבודה 24 שעות ביממה בנמל.
מנכ"לית משרד התחבורה קרן טרנר אמרה בדיון כי הנושא נדון אצל שר התחבורה והוסכם כי רשות מקרקעי ישראל תממן את כל ההתאמות הנדרשות כדי לאפשר לנמל להמשיך ולפעול.