שר התחבורה היוצא בצלאל סמוטריץ' הודיע כי הרכבת תחזור לפעול רק ב-1 ביוני, ולא בראשון הקרוב כפי שפורסם בימים האחרונים. לדבריו, ברכבת יופעלו קווים ישירים בלבד, ללא עצירות בתחנות ביניים, ומספר הנוסעים יוגבל.

פתיחת הרכבת אומנם נקבעה לראשון הקרוב, ה-16 במאי, כשבועיים לאחר שאר חלקי המשק. עם זאת, בשל עבודות תשתית וחשמול, בין ה-16 במאי ועד ה-1 ביוני, נתן יהיה להפעיל את הרכבות מצפון עד תחנת נתניה בלבד, ומשם הנוסעים יוכלו להמשיך באוטובוסים. המניע להחלטה לדחות את ההפעלה הוא לאפשר תנועה בקווים הישירים, שתאפשר ויסות של מספר הנוסעים.

סמוטריץ' ציין כי את ההחלטה על דחיית הפעלת הרכבת בשבועיים קיבל ראש הממשלה בנימין נתניהו. "אני סבור שזו החלטה שגויה שאינה מאזנת נכון בין שיקולי הבריאות לצרכי המשק והתחבורה".