ברכבת נוסעים בעקביות קרוב ל-90,000 נוסעים בכל יום חול (א'-ה'), בסטיות של 2,000 נוסעים, יותר או פחות. זאת בהשוואה לשגרה של 250,000 עד 260,000 נוסעים ביום, בתקופה שקדמה לקורונה.
עד כה, בחודשיים שעברו מאז שבה הרכבת לפעילות ב-22 ביוני, מספר חד ספרתי של רכבות הגיע למגבלה של 500 נוסעים. מקרים אלו התרחשו בנסיבות חריגות יחסית כאשר על פי רוב, הרכבות נוסעות ריקות יחסית, ומעניקות לנוסעים חווית נסיעה מרווחת ושקטה יחסית.
ב-10 באוגוסט התרחש אירוע טרגי בו אדם הטיל עצמו על פסי רכבת בסמוך לרמלה, כך שהנוסעים ברכבת לבאר שבע, הועברו לרכבת שנוסעת לדרום ומילאו את הרכבת. בתחנת נבון בירושלים הגיעו למגבלה של 500 נוסעים נכנסים במהלך החג עיד אל אדחא המוסלמי.
הסיבות לירידה במספר הנוסעים מורכבות מחשש מפני המגיפה שמדיר מהרכבת אוכלוסיות בקבוצת סיכון; הוצאה המונית לחל"ת; וגם השבתת הפעילות לנתב"ג, כאשר גם אין כמעט טיסות.
ברכבת מדווחים שחלק גדול מהנוסעים מזמין את השוברים בסמוך למועד הנסיעה. פרוצדורת השוברים מייצרת מעת לעת תורים בכניסה לתחנות הרכבת, אך ההמתנה אורכת בין דקה ל-5 דקות.
מבחינת עובדי הרכבת, חלקם מקבלים כעת שכר מופחת, לאור הפחתת או ביטול מוחלט של שעות נוספות. העובדים סיימו את מרבית ימי החופשה שלהם בזמן החל"ת, בהתאם להסכמים מול הממשלה במגזר הציבורי.
כמעט בכל יום יש מקרי חשיפה
על מנת להעריך את ההשפעה של הפעלת התחבורה הציבורית על התפשטות המגפה, במשרד הבריאות מנטרים את מספר החולים שהתברר שנסעו ברכבת. בדיקה באתר משרד הבריאות מעלה כי ביום ב' השבוע, אותר נדבק בודד בקורונה ברכבת ישראל, אך ביום א' השבוע אותרו 4 כאלו.
היום צפוי להתפרסם דו"ח הרבעון השני של רכבת ישראל, שאמור לשקף את הפגיעה הכלכלית שנגרמת כתוצאה מהירידה בנוסעים. בשנת 2021 אמור ממילא להיחתם הסכם הפעלה חדש מול משרד התחבורה. על מנת למנוע מהרכבת להיכנס לגרעונות כרוניים, יצטרכו במשרד לפתוח את הכיס, ולהקטין את התלות הכלכלית של הרכבת במצב הנוסעים היורד, לפחות כל עוד שגרת החירום של מגיפת הקורונה נמשכת.
