שלושה פלסטינים, מחבל ושני אנשי ביטחון מהמנגנונים הפלסטיניים, נהרגו הלילה (בין רביעי לחמישי) בחילופי אש עם כוחות הביטחון בג'נין, בעת כניסת הכוחות לעיר לביצוע מעצרים.

מסתערבים מימ"מ נכנסו לעיר כדי ללכוד שני מבוקשים, ג'מיל אל-עאמורי וויסאם אבו זיד, שלפחות אחד מהם מזוהה עם הג'יהאד האיסלאמי. השניים היו מעורבים בפיגועי ירי לעבר כוחות הביטחון בחודשים האחרונים.

שני המבוקשים הסתתרו ליד מבנה ששייך למודיעין הצבאי הפלסטיני. כוח ימ"מ פעל בג'נין לצד צה"ל ושב"כ, ובשל העובדה שהכוח היה מסוערב, צה"ל לא עדכן מראש את המנגנונים על הכניסה. כשהכוח החל במבצע המעצרים ליד המבנה, שני המבוקשים פתחו בירי לעבר הכוחות והתפתחו חילופי אש כבדים ביניהם. שני ההרוגים מהמנגנונים הפלסטיניים, אדהם עליווי (בן 23) ותייסיר עיסא (33), נהרגו במהלך חילופי האש. השניים הם קצינים בדרגות המקבילות לסגן משנה ולסרן.

חילופי האש נמשכו ולבסוף המבוקש אל-עאמורי, איש הג'יהאד האיסלאמי, נהרג. אבו זיד נפצע ונתפס, והכוח לקח אותו חזרה לישראל. לא היו נפגעים בקרב כוחות הביטחון.