שב"כ מנהל זה מספר חודשים חקירה חשאית נגד השר לביטחון לאומי איתמר בן גביר והמשטרה בחשד לחתירה תחת סדרי השלטון במדינה, כך לפי דיווח של עמית סגל שפורסם הערב (ראשון) בחדשות 12.
לפי הפרסום ראש השב"כ רונן בר, שהממשלה הודיעה לאחרונה על הדחתו ובג"ץ הודיעה על השהייתה עד לדיון בנושא, כתב בספטמבר לאנשי הארגון: "סימנו את התפשטות הכהניזם למוסדות אכיפות החוק כתופעה מסוכנת, שמניעתה היא חלק מייעוד השב"כ. נוכח המעורבות של דרגים פוליטיים יש לעשות זאת בשום שכל, ובמשנה זהירות יש להמשיך ולאסוף ראיות ועדויות למעורבות הדרג המדיני בעשיית הדרג הביטחוני, בכיוון הפעלת הכוח באופן המנוגד לחוק, ולבוא עם כמה ממצאים".
בשב"כ לא הכחישו את הפרסום, ומסרו בתגובה: "תנועות כ"ך ו'כהנא חי' הוכרזו כהתאחדויות בלתי מותרות בשנת 1994, ומאז שנת 2016 מוגדרות כארגוני טרור. פעילותם של ארגונים אלה נמשכה גם לאחר מכן, והשירות פעל לחשוף אותה ולסכלה, בהתאם לייעודו בחוק – בהמשך לכך, וככל שמתקבל מידע בנושא, מטפל השירות גם בחשש מחדירת גורמים אלו למוסדות השלטון, ובפרט למוסדות אכיפת החוק".
בדיווח נטען שראש הממשלה בנימין נתניהו עודכן על החקירה. בלשכתו הכחישו: "ראש הממשלה לא מכיר חקירה ולא עודכן בידי ראש השב"כ אודותיה".
בלשכת השר בן גביר מסרו: "מדובר ברעידת אדמה. עכשיו מובן עוד יותר למה אסור להשאיר את רונן בר אפילו לדקה אחת כראש שב"כ. ראש ארגון חשאי שיוזם חקירות ואיסוף חומרים נגד נבחרי ציבור, כשהוא מגדיר מראש את היעד, 'לאסוף ראיות ועדויות למעורבות הדרג המדיני', הוא סכנה מיידית לדמוקרטיה שחייב לעוף מיידית מכל תפקיד. פשוט לא להאמין שארגון ביטחוני בישראל חותר תחת השלטון וחוקר חקירה פוליטית במטרה לעשות הפיכה פוליטית נגד רצון העם".
