דו"ח מבקר המדינה לחודש נובמבר 2024 מצביע על מחסור חמור במפקחים של מס הכנסה. לפי הדו"ח בין השנים 2019 ל-2023 מספר מפקחי ורכזי מס הכנסה צנח בכ-31.5%, מ-833 ל-570. הירידה נגרמה בשל עזיבה בהיקף רחב של עובדים, ביניהם רבים מנוסים ואף בכירים, ולמרות גיוס נרחב של עובדים חדשים. מחסור זה מהווה מכשול מהותי ביכולת המדינה לגבות מיסים ומוביל להכנסה נמוכה מזו שהייתה אמורה להיות.

המבקר התייחס בדו"ח, כחלק מפרק שעוסק במיסוי מטבעות דיגיטליים, לבעיות נוספות הנגררות מהמחסור. הכשרת מפקחי מס הכנסה, כולל תקופת התמחות, אורכת זמן רב, והעזיבה המאסיבית גוררת איתה איבוד ידע קריטי, בין היתר בתחום המטבעות הדיגיטליים. המחסור מוביל לירידה בטיפול במקרים, ולפגיעה בגביית המס ובהרתעה בנושא עבירות מס. בסוף שנת 2023 רשות המיסים פרסמה תכנית לשימור עובדים הכללה "מענק שימור", אך לפי המבקר הרשות לא פעלה מספיק בשנים שלפני כן להפחית את מגמה הירידה בכמות העובדים.

נושא מיסוי הקריפטו (מטבעות דיגיטליים) מספק דוגמא לחשיבות שימור כוח האדם והידע במס הכנסה עבור מדינת ישראל. ישראל הייתה מהמדינות הראשונות לפרסם עקרונות למיסוי בתחום, אך בשנים האחרונות מדינות האיחוד האירופי, ארצות הברית ומדינות נוספות קידמו את הנושא, וישראל נותרה מאחור. שוק הנכסים הדיגיטליים הגיעו בשיאו לכ-3 טריליון דולר, ופוטנציאל גביית המיסים ממנו בישראל מוערך בכ-2-3 מיליארד שקלים בשנה. כיום מתוך כ-200 אלף משתמשים בישראל רק כ-500 מדווחים לרשות המיסים.

נתונים אלה מתפרסמים במקביל לאישור הממשלה את תקציב 2025, הכולל קיצוצים נרחבים והעלאות במיסים שיפגעו גם במעמד הביניים ובשכבות החלשות. לצד צעדים אלה שזוכים לביקורת רבה, נראה כי הממשלה לא עושה את כל שביכולתה למצות את הכנסותיה ממס מרכזי שכבר קיים בחוק. מס הכנסה מהווה מעל 20% מהכנסות רשות המסים והוא מהווה מס פרוגרסיבי, בו בעלי הכנסה גבוהה יותר משלמים מס גבוה יותר.