במשרד להגנת הסביבה הצליחו לרכך את הצעת האוצר בחוק ההסדרים לפגיעה חמורה בסמכות רשות הטבע והגנים, כך על פי טיוטה חדשה של החוק שהגיעה לידי 'דבר'. עם זאת, נותרו סעיפים אחרים, שלטענת המשרד עלולים לפגוע באופן חמור בסביבה: עיקורה של הוועדה האמונה על הגנת החופים, ניסוח פרמטרים לשמירה על הסביבה בידי מנהל התכנון, והפרטת הייעוץ הסביבתי כך שמנהל התכנון יעסיק את המפקחים עליו.
המשרד להגנת הסביבה הזהיר כי "יש פה ניסיון לעקר את יכולת המשרד להתריע לפני אסון", והוסיף כי מדובר ב"לתת לחתול לשמור על השמנת". ההצעה שבמחלוקת נכנסה לטיוטת חוק ההסדרים שפורסמה בתחילת נובמבר, והופיעה תחת הכותרת "האצת פרויקטי תשתית לאומית". ההצעה מורכבת ממספר סעיפים שונים, כשהבולט שבהם היה סעיף שקבע כי פרויקט שיוגדר "מיזם תשתית חיוני" לא יידרש לקבל אישור בנייה מרשות הטבע והגנים גם אם יבנה ממש על שטח השמורה עצמה. מדובר למעשה באישור פתוח לאוצר ולמנהל התכנון לבנות על שמורות טבע וגנים, שכן רשות הטבע והגנים היא הגוף היחיד שאמון על הגנת שטחים אלה.
"מיזם תשתית חיוני" היא הגדרה בחוק למיזמים מסוימים, כשההחלטה האם מיזם מסוים יוגדר כך נתונה בידי שר האוצר. המשמעות המעשית של הנוסח המקורי, על פי גורמים במשרד להגנת הסביבה, הייתה כי משרד האוצר יוכל לעקוף את רשות הטבע והגנים ללא כל התייעצות, כאשר ההכרעה האם מדובר בצורך חיוני תישאר בידיו בלבד.
כך למשל, אם יוחלט לבנות תחנת כוח ליד שמורת טבע, או להעביר צינור דרך גן לאומי, ורשות הטבע והגנים תתנגד, משרד האוצר לא יידרש כלל לבקש את אישורה. הצעה זו, מטבע הדברים, גררה התנגדות רבה של המשרד להגנת הסביבה, וכנראה גם כמה כיפופי ידיים מאחורי הקלעים. בסופו של דבר, על פי הנוסח החדש שהגיע לידי 'דבר', הפגיעה בסמכות הרשות רוככה מעט.
בנוסח החדש, נכון לכתיבת שורות אלה, תישמר לרשות הטבע והגנים היכולת להטיל וטו, אולם שר האוצר יוכל להגיש ערר על הווטו. אם רשות הטבע והגנים לא תענה לערר בזמן קצוב, יפנו שני הצדדים לוועדת בוררות. הרכב הוועדה ימונה במשותף על ידי משרד האוצר, משרד הפנים והמשרד להגנת הסביבה.
על פי רני עמיר, סמנכ"ל בכיר לתכנון, משאבי טבע וחוסן אקלימי במשרד להגנת הסביבה, "מדובר בפגיעה ביכולתנו להגן על הסביבה ובריאות האזרחים, אולם בפשרה עדיפה בהרבה על ההצעה המקורית". דבריו מתייחסים לסעיף שרוכך בטיוטה החדשה, זה העוסק בסמכות רשות הטבע והגנים לאשר או למנוע מיזמי תשתית חיוניים.
לדבריו, שלושת הסעיפים האחרים שנותרו בעינם גם בהצעה החדשה לחוק ההסדרים, עלולים לפגוע באופן חמור ביכולתו של המשרד להגנת הסביבה להגן על הסביבה ועל האזרח. "אנחנו נגד זה באופן מוחלט", אמר עמיר, "וניאבק מול זה על הרגליים האחוריות, בשביל אזרחי ישראל".
