לוחמי עוצבת הקומנדו, שייטת 13, כוחות שב"כ וכוחות מיוחדים נוספים הפועלים תחת אוגדה 98 איתרו בבית החולים נאצר שבחאן יונס תרופות עם שמות חטופים, מצבורי נשק וכן רכב שכנראה נגנב מקיבוץ ניר עוז ב-7 באוקטובר, כך מסר דובר צה"ל.

מאות מחבלים וחשודים בטרור שהסתתרו בבית החולים נעצרו, בהם משתתפים בטבח 7 באוקטובר וחשודים בהחזקת חטופים. רבים מהם לבשו מדי צוות רפואי.