בישראל הופתעו מהחלטתו של התובע הכללי קארים חאן. במשרד החוץ סבורים שבקשתו של קאן מבית הדין הפלילי הבינלאומי בהאג (ICC) להוציא צווי מעצר נגד ראש הממשלה נתניהו ושר הביטחון גלנט נעשתה באופן בלתי צפוי, בחוסר תום לב, בניגוד גמור לעקרונות בסיסיים של המשפט הבינלאומי ובמיוחד של עקרון המשלימות לפיו בית הדין אמור להסתמך על מערכת המשפט הריבונית של ישראל.
דרגים מקצועיים ממשרדי החוץ והביטחון, ממשרדו של היועץ המשפטי לממשלה, ומגופים ממשלתיים נוספים הציגו בפני התובע קאן את נהלי קבלת ההחלטות, החל מנוהל פתיחה באש ועד לקבלת החלטות על יעדי תקיפה. בין הוצגו הוכחות לכך שישראל מנהלת מערכת משפט עצמאית, ושלצה"ל יש מנגנוני בדיקה עצמאיים. התובע חאן אמור היה לבקר בארץ ולהיפגש עם צוותים ישראלים בשבוע הבא. ההכנה לביקורו אמורה הייתה להתחיל היום.
בישראל סבורים שעצם העובדה שהתובע חאן מבקש להוציא צווי מעצר גלויים, ולא חשאיים, מחזק את החשד שזה נעשה בחוסר תום לב. ישראל תנסה להשפיע ככל שניתן על מדינות החתומות על אמנת רומא שמתוקפה פועל ה-ICC לגנות את החלטתו של התובע קאן, ולהכריז שלא ישתפו פעולה עם צווי המעצר. מבין 123 המדינות החברות בבית הדין גינו עד כה במפורש את ההחלטה רק שלוש (צ'כיה, הונגריה ובריטניה) שמלכתחילה לא הכירו בהחלטה של בית הדין לפתוח בחקירה נגד ישראל מתוקף הכרעה כי פלסטין נחשבת למדינה בפני בית הדין – החלטה מעוררת מחלוקת ששבע מדינות דחו בפומבי. לצד הגינויים החריפים של צ'כיה, הונגריה ובריטניה, גם אוסטריה גינתה את ההחלטה להעמיד בשורה אחת את ראשי חמאס וממשלת ישראל, אולם הגינוי שלה איננו חד משמעי. בלגיה ודרום אפריקה לעומת זאת ברכה על המהלך.
צווי המעצר, אם ייצאו, הם אחד ההישגים הגדולים החשובים ביותר של הפלסטינים, והם עלולים לפגוע במאמץ הצבאי של ישראל ובמאבק לשחרור החטופים. עיקר הנזק ממנו חוששים בישראל הוא יצירת משוואה חדשה בזירה הבינלאומית לפיה חמאס וישראל שווים. הסימטריה הזו בין ישראל לחמאס עשויה לפגוע במאמצים הישראלים בכל הזירות: בזירה הבינלאומית, בזירה המדינית וגם בזירה הצבאית. קיים חשש מפגיעה במאמצי המשא ומתן בין ישראל לחמאס, ולתת תנופה לפלסטינים בזירה הבינלאומית. בישראל חוששים שהמאבק העיקש בארגוני טרור יפגע כתוצאה מהחלטות של בתי הדין הבינלאומיים בהאג. כמו כן קיים החשש שהחלטתו של ה-ICC תטה גם את בית הדין הבינלאומי לצדק (ICJ) נגד ישראל.
ממשרד החוץ נמסר כי "החלטת התובע כרים חאן היום היא האבסורד בהתגלמותו: התובע מבקש להעמיד בשורה אחת את התוקפים ואת המותקפים. זו איוולת שאין כדוגמתה ולא היתה כדוגמתה. זהו ליקוי מאורות של התובע הכללי כרים חאן. ישראל היא הקורבן לפשעי החמאס, שחרט על דגלו את השמדת ישראל, חולל פשעים נגד האנושות ופעולות ג'נוסייד ב-7 באוקטובר, ביצע פשעי מין מהחמורים שראה העולם וממשיך לתקוף את אזרחי ישראל ולהחזיק גם בשעה זו 128 חטופות וחטופים".
"חמאס מבצע את כל פשעי המלחמה הללו ומוסיף חטא על פשע כשהוא משתמש בתושבי עזה ככלי מלחמה וכמגנים אנושיים. ישראל פועלת ברצועת עזה במטרה להגן על אזרחיה, לשחרר את החטופים ולהסיר את שלטון הטרור של חמאס כך שלא יוסיף לאיים על בטחון אזרחיה, וכל זאת בהתאם לדין הבינ״ל ולחובותיה ההומניטריות. ישראל תמשיך לפעול בים, באוויר וביבשה כדי להעביר סיוע הומניטרי לאוכלוסייה האזרחית בעזה".
"האשמות התובע הכללי חאן חסרות שחר, מופרכות, מעוותות את הדין הבינ״ל, רומסות את כללי בית הדין עצמו ופוגעות בכל מדינה דמוקרטית המגנה על עצמה ונאבקת בטרור. מדינת ישראל היא מדינת חוק דמוקרטית בעלת מערכת משפט עצמאית ואפקטיבית, הזוכה להערכה ברחבי העולם. ישראל אינה מדינה חברה בבית הדין וכמו מדינות אחרות אינה מכירה בסמכותו לגבי הסכסוך. אנו קוראים לדחייה על הסף של בקשת התובע ופונים למדינות העולם החופשי להתייצב נגד המהלך השערורייתי הזה החותר תחת עקרונות הצדק והמוסר הבסיסיים. זהו יום שחור למוסד בית הדין הפלילי הבינ״ל".
